Peptides néoantigènes|Synthèse personnalisée de peptides néoantigènes|Personnalisation des peptides longs/insolubles|Science-Peptide

 

Méta-description

 

Besoin de peptides néoantigènes de haute qualité pour un vaccin personnalisé contre le cancer ou le dépistage des lymphocytes T ? Science-Peptide fournit un service de synthèse de peptides néoantigènes, prenant en charge les peptides longs, les séquences réfractaires, la modification multi-sites, la haute pureté et la livraison rapide, pour aider la recherche en immunothérapie tumorale. Bienvenue à nous contacter.

 

Peptides néoantigènes|Ingrédients clés pour l'immunothérapie personnalisée

 

Comme le savent tous les spécialistes de l’immunothérapie tumorale, trouver une bonne cible n’est pas facile, et synthétiser les peptides néoantigènes prévus avec une haute qualité est également un défi. Ces peptides sont souvent longs, insolubles et contiennent des acides aminés hydrophobes, impossibles à synthétiser par les méthodes de synthèse normales. Nous sommes dans le domaine des peptides depuis 20 ans et nous avons reçu de nombreuses commandes de peptides néoantigènes, et nous avons rencontré toutes sortes de difficultés - certains doivent être livrés à temps pour la fenêtre thérapeutique du patient, certains peptides ne peuvent pas être bien agités dans l'eau et certains ont plusieurs sites de mutation encombrés. Ce sont ces expériences qui nous ont amenés à construire un système de synthèse spécifiquement pour les peptides néoantigènes, et chaque étape, de la conception de la route à la stratégie de purification, visait à résoudre les problèmes.

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Que sont les peptides néoantigènes ?

 

Les peptides néoantigènes sont simplement des fragments protéiques uniques produits par des mutations dans les cellules cancéreuses. Ces mutations comprennent des mutations ponctuelles, des délétions par insertion et des fusions de gènes qui aboutissent à des séquences d'acides aminés différentes de celles des cellules normales. Lorsque ces peptides sont présentés à la surface cellulaire par les molécules du CMH, le système immunitaire reconnaît que « c'est mauvais » et attaque.

 

En pratique, les peptides néoantigènes se répartissent en deux catégories principales :

Peptides longs (25-35 aa) :encapsulent le site de mutation et les séquences environnantes, doivent être avalés par les cellules dendritiques, traités puis présentés, couramment utilisés dans les vaccins personnalisés.

Peptides courts (8-11 aa) :épitopes de liaison au CMH prédits ou validés qui peuvent être utilisés pour stimuler les cellules T directement ou pour la tétramérisation.

Qu'il s'agisse d'un peptide long ou d'un peptide court, les synthétiseurs de Neoantigen Peptide ont les mêmes maux de tête : la séquence est hydrophobe, il est facile d'être « frappé » par le synthétiseur, le rendement est faible lors de la purification et il doit être délivré à temps pour le traitement du patient.

 

Comment Science-Peptide résout-il ces dilemmes ?

 

1. Spécialisé dans les peptides longs et insolubles
Une grande partie des peptides néoantigènes qui nous parviennent contiennent plus de 25 acides aminés. Les méthodes conventionnelles sont souvent inefficaces pour traiter ces peptides. Au fil des années, nous avons trouvé plusieurs façons de les gérer :

  • Fragmentation : Le peptide long est coupé en plusieurs segments et synthétisé séparément, chaque segment est d'abord purifié, puis assemblé sur résine ou en phase liquide. De cette façon, la qualité de chaque segment est garantie et le rendement et la pureté du produit final sont plus élevés.
  • Synthèse assistée par micro-ondes : certains acides aminés sont réticents à réagir avec le chauffage par micro-ondes, l'efficacité de la réaction sera immédiatement augmentée et il y aura moins de sous-produits-.
  • Purification spéciale des solvants : certains peptides ne sont pas solubles dans les solvants courants, nous ajoutons donc du DMSO, du chlorhydrate de guanidine et d'autres solvants puissants pendant la purification pour les éliminer de la colonne, et ils peuvent toujours conserver de bonnes propriétés après lyophilisation.

 

2. Il ne manque pas un seul site de mutation
L’essence des peptides néoantigènes réside dans ces quelques sites de mutation, sur lesquels on ne peut jamais se tromper lors de la synthèse. Nous utilisons la synthèse en phase solide Fmoc-pour introduire directement des acides aminés non-naturels, et nous gardons un œil sur les données après chaque étape de couplage pour nous assurer que les séquences d'acides aminés des sites de mutation sont exactement les mêmes que celles de la conception.

 

3. La vitesse est difficile
La fenêtre thérapeutique pour les patients atteints de tumeurs est si large que les peptides n’ont aucun sens s’ils sont tardifs. Nous avons donné le feu vert aux Neoantigen Peptides :

  • Peptides courts (<20 aa): 10 working days
  • Peptides longs (20-35 aa) : 12-18 jours ouvrables
  • Accéléré : 7 jours ouvrables est négociable si vous êtes vraiment pressé

L'année dernière, il y avait un client qui avait déjà organisé ses patients et attendait les peptides pour fabriquer un vaccin. Plusieurs de nos synthétiseurs ont travaillé en équipe pour lui livrer les 30 peptides en deux semaines.

 

4. Critères stricts de pureté et d’endotoxines
Lorsque vous utilisez quelque chose sur des personnes, vous ne pouvez pas vous permettre de faire des compromis sur la qualité. Nous proposons des peptides néoantigènes :

  • Purity:>90%, >95%, >98 % Quel que soit votre choix
  • Endotoxine:<2 EU/mg, or customized according to customer requirements
  • Limite microbienne : conforme à la Pharmacopée
  • Solvants résiduels : selon ICH Q3C

Le rapport COA de chaque peptide est accompagné de graphiques HPLC et MS, et les données peuvent être retracées, de sorte que de nombreux clients le prennent directement et le mettent dans la déclaration.

 

5. Le toilettage peut également être effectué
Certaines expériences nécessitent une « poignée » pour les peptides néoantigènes :

  • Marquage biotine : pour le tétramère du CMH
  • Marquage fluorescent (FITC, TAMRA, Cy5) : pour la coloration continue
  • Couplage de protéines porteuses (KLH, BSA) : pour l'immunisation des animaux
  • Modification de l'acide palmitique : améliorer la détection des ganglions lymphatiques par les vaccins

Nous pouvons tout faire ensemble, sans que vous ayez à trouver deux fournisseurs.

 

Paramètres techniques et capacités de personnalisation

 

Paramètres

Description

longueur du polypeptide

8-50 amino acids (>35 acides aminés recommandés pour l'évaluation)

Type de mutation

mutations ponctuelles, délétions par insertion, sites de fusion

échelle synthétique

Milligrammes, grammes (pour les études précliniques)

niveau de pureté

>90%, >95%, >98 % sélectionnable

Endotoxines

<2 EU/mg or customized

Modificateurs facultatifs

Biotine, FITC, TAMRA, Cy5/Cy7, couplage KLH/BSA, acide palmitique

programme de contrôle de la qualité

Pureté HPLC, confirmation du poids moléculaire MS, validation du site MS/MS (facultatif), détection des endotoxines

forme de livraison

Poudre lyophilisée (tube ou flacon)

 

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Où les peptides néoantigènes peuvent être utilisés

 

01/

Vaccins néoantigènes personnalisés
Nous mélangeons plusieurs peptides néoantigènes prédits, ajoutons un peu d'adjuvant et les injectons dans la peau du patient pour activer ses propres lymphocytes T-. Nous avons fabriqué des peptides de type GMP-pour plusieurs sociétés de biotechnologie pour une utilisation clinique de phase I.

02/

Criblage et expansion des cellules T-
En utilisant des peptides néoantigènes pour stimuler les PBMC chez les patients, les cellules T qui reconnaissent le nouvel antigène peuvent être sélectionnées, développées, puis réinfusées aux patients. Les peptides biotinylés que nous fabriquons peuvent être utilisés pour préparer des tétramères du CMH, qui peuvent être triés par cytométrie en flux.

03/

Surveillance de la vaccination
Nous pouvons fournir des peptides de haute pureté pour les prélèvements sanguins avant-et post-traitement, et mesurer le nombre de lymphocytes T spécifiques du néoantigène-T-avec des peptides néoantigènes pour savoir si le vaccin fonctionne ou non, ainsi que des tests ELISpot et ICS.

04/

Développement TCR-T
Vous souhaitez trouver une séquence TCR qui reconnaît un néoantigène ? Vous devez effectuer un dépistage avec des peptides néoantigènes. Nous avons réalisé un certain nombre de ces projets, et nous disposons de suffisamment de peptides et pouvons en fournir des biotinylés pour les tests d'affinité.

 

Pourquoi la science-les peptides néoantigènes de Peptide ?

 

1. 20 années d'expérience et de nombreux problèmes difficiles
Nous sommes dans ce domaine depuis 20 ans, et nous avons rencontré toutes sortes de peptides difficiles, et nous avons un moyen de gérer les longues chaînes, les séquences hydrophobes et répétitives qui sont communes aux peptides néoantigènes, et nous ne vous dirons pas facilement que nous ne pouvons pas le faire. Certains peptides que d’autres pensent impossibles à fabriquer, nous pouvons souvent trouver une issue après quelques jours de recherche.


2. Suivre le rythme du traitement
Le traitement des tumeurs ne peut pas attendre. Nous avons-accéléré le programme sur les peptides néoantigènes, en donnant la priorité à l'ensemble du processus, de l'évaluation à la livraison. De nombreux clients nous ont dit plus tard qu'ils nous avaient choisis parce que nous leur avions livré le peptide dans les délais dont ils avaient besoin.


3. La qualité peut être vérifiée
Qu'il s'agisse de peptides bruts pour la recherche scientifique ou de peptides de haute pureté à faible teneur en endotoxines pour la recherche préclinique, nous les traitons tous de la même manière : pas moins d'une inspection de qualité et pas moins d'une des données qui doivent être fournies. De nombreux clients copient directement notre rapport COA et l'insèrent dans les documents de déclaration.


4. Des milligrammes aux grammes, sans remplacement
La détection précoce ne représente que quelques milligrammes, les études toxicologiques représentent des dizaines de grammes, les essais cliniques représentent des centaines de grammes - du début à la fin, nous pouvons tout prendre. Vous n’êtes pas obligé de changer la même espèce et vous n’avez pas à vous en soucier.


5. Votre séquence, telle que vous et moi seuls la connaissons
La nouvelle séquence antigénique est l’atout principal de chaque client. Nous signons un accord de confidentialité, les informations sur le projet ne sont connues que de quelques personnes de l'équipe projet et le système de données est sécurisé. Durant toutes ces années, il n’y a jamais eu de fuite.

 

Les histoires vraies de plusieurs clients qui

 

Une entreprise de thérapie cellulaire :ils ont un patient atteint d'un mélanome avancé qui attend un vaccin personnalisé. 30 peptides longs, 25-35 acides aminés, dont 8 extrêmement hydrophobes, et le rendement de purification par les méthodes ordinaires est extrêmement faible. Nous avons utilisé une condensation de fragments et des solvants spéciaux pour purifier les peptides, et nous les avons tous livrés au client dans un délai de deux semaines, et l'endotoxine a été contrôlée pour être inférieure à 0,05 UE/mg. Plus tard, après le traitement du patient, plusieurs nouveaux clones spécifiques de l'antigène - ont été amplifiés par test de lymphocytes T, et le client nous a spécifiquement appelé pour nous dire que "la qualité du peptide a beaucoup aidé".

 

Un institut de oncologie de premier plan : they want to screen a batch of neoantigen-reactive TCRs and need 200 predicted peptides (9-11 aa). We synthesized all the peptides in three weeks using a high-throughput platform, and each peptide was >95% pur et confirmé par MS. Le client a utilisé ces peptides pour fabriquer des tétramères et a sélectionné plusieurs TCR à haute-affinité, qui sont actuellement en développement préclinique.

 

Quelques questions que vous pourriez poser

 

Q : Comment savoir quelles mutations constituent de bons néoantigènes ?

R : Nous ne nous impliquons pas dans la prédiction, c'est le travail de la bioinformatique. Mais si vous nous envoyez la séquence prévue, nous pouvons vous dire si elle est difficile à synthétiser et si vous devez ajouter quelques résidus aux extrémités pour rendre le processus plus fluide.

Q : Quelle est la certitude de fabriquer un long peptide ?

R : Pour 25 à 35 acides aminés, plus de 85 % d’entre eux conviennent. S'il y en a des particulièrement difficiles à dissoudre ou très répétitives, vous devrez peut-être essayer plusieurs stratégies (par exemple condensation de fragments, ajout de pseudoproline), et le temps de cycle sera allongé, mais la plupart d'entre elles pourront finalement être résolues.

Q : Puis-je fabriquer des peptides à usage clinique ?

R : Oui. Nous fournissons des peptides néoantigènes de qualité GMP-avec un contrôle strict des endotoxines, un remplissage aseptique, un ensemble complet d'enregistrements de production par lots, et nous coopérerons avec vous pour effectuer le dépôt IND.

Q : Comment conserver le nouveau peptide antigénique ?

R : La poudre lyophilisée peut être conservée à -20 degrés pendant deux ans. Après dissolution, il est préférable de le mettre dans des emballages séparés à -80 degrés, de ne pas le congeler et de le décongeler encore et encore. Les peptides contenant du Cys doivent être protégés de l'oxydation.

 

Vous souhaitez personnaliser vos peptides néoantigènes ? N'hésitez pas à discuter

 

Que vous débutiez dans la recherche préclinique ou que vous participiez déjà à un essai clinique et que vous ayez besoin d'un peptide personnalisé pour un vaccin, Science-Peptide peut s'en charger. Notre équipe technique est à l’écoute de vos besoins.